Opheus ist ein einfach zu bedienendes Programm zum Verschlüsseln jeder beliebigen Datei. Die Verschlüsselung basiert auf einer 1024-Bit bis 8192-Bit Matrix (kann vom Benutzer eingestellt werden) und verwendet ein pseudo OTP-Verfahren (One Time Pad). Hierbei wird ein temporärer Kodierschlüssel erzeugt, der grösser ist, als die zu verschlüsselnde Datei. Welche Fragmente aus dem temporär erzeugten Schlüssel verwendet werden, entscheidet sich zur Laufzeit und ist von der verwendeten User-Matrix abhängig. Für die Berechnung der Code-Matrix (dient der Verschlüsselung) muß der Benutzer eine eigene Matrix (User-Matrix) und mindestens einen Passwortsatz angeben. Optional kann ein zweiter Passwortsatz angegeben werden. Die Matrix kann frei gewählt werden, es lassen sich Zufallsmatrizen errechnen, oder sie können jede beliebige Datei (mindestens 128 Byte gross) verwenden, um aus ihr eine Matrix zu benutzen. Diese Matrix wird für das Entschlüsseln wieder benötigt. Bei Verwendung einer eigenen 8192-Bit starken Matrix (1024 Byte) und einem Passwortsatz kann so eine Verschlüsselungsstärke von 16384 Bit erreicht werden.